En janvier 2016 un attentat a eu lieu à Jakarta ; les touristes doivent redoubler de prudence dans les lieux fréquentés et éviter les regroupements dans les lieux publics touristiques. D’autres actes de violences sont commis dans certaines régions : la Papouasie, l’île de Célèbes, les Moluques.
Les femmes doivent être attentives aux tenues qu’elles portent dans ce pays musulman, en particulier dans la province d’Aceh. Des actes de piraterie sont commis dans les eaux territoriales, pour votre sécurité en Indonésie, il faut donc éviter les zones dangereuses. De nombreuses régions sont soumises à des séismes, des éruptions volcaniques et des tsunamis.
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